هات بلاک هات بلاک

 | تاریخ ارسال: 1399/5/4 | 
هات بلاک 

هات بلاک یک بلوک آلومینیومی جامد است که به منظور تسهیل پروسه های کار با مواد بیولوژیک و حساس به حرارت طراحی گردیده است. در برخی شرایط همچون کار با آنزیم، پروتئین،DNA ،  RNAدر در روش های مختلف آزمایشگاهی نیازمند شرایط گرم می باشند که با احاطه کردن میکروتیوب و تضمین پایداری دمای گرم، بوسیله این بلوک ها ، علاوه بر حفاظت دمایی و فیزیکی از نمونه ها باعث تسهیل و تسریع در انجام کار نیز می گردد.
این بلوک ها با ظرفیت ۹۶ میکروتیوب در اندازه های مختلف ۰.۲، ۰.۵ و ۱.۵ و با قابلیت دمایی ۲۵+ الی ۱۱۰+ درجه سانتی گراد ارائه می گردد.
همچنین با دارا بودن صفحه نمایش، دمای مورد نیاز به آسانی تنظیم شده و نظارت دقیق بر دمای واقعی را فراهم می کند.
مزایا و ویژگی ها
  • سرعت بخشیدن به کارایی نمونه
  • کوتاه کردن زمان آماده سازی نمونه
  • سهولت قرار گیری میکروتیوب در چاهک ها
  • دستیابی به بهره وری با اطمینان بیشتر از روش های فعلی
  • توزیع یکنواخت گرما در تمامی چاهک ها در کوتاهترین زمان ممکن

واکسن

 | تاریخ ارسال: 1399/3/27 | 
واکسن 


هر گونه اقدامی که به منظور جلوگیری از بروز عفونت و یا تخفیف شکل طبیعی بیماری در فردی با تجویز آنتی بادی یا آنتی‌ژن بعمل آید ایمن‌سازی گفته می شود .
با تزریق عضلانی یا وریدی آنتی بادی ایمنی غیرفعال یا انتقالی ایجاد میگردد .دوام این نوع ایمنی کوتاه است و بستگی به نیمه عمر آنتی‌بادی در بدن فرد دریافت کننده دارد و این مدت معمولا حدود ۳ تا ۴ هفته می‌باشد.
درصورت تجویز آنتی‌ژن که شامل میکرو ارگانیسم ضعیف شده ، کشته شده ویا اجزاء آن می‌شود دستگاه ایمنی فرد دریافت کننده تحریک و بطور فعال آنتی‌بادی تولید می‌کند.ایمنی بدست آمده دراین حالت را ایمنی فعال گویند. دوام این نوع ایمنی ، طولانی تر از نوع غیرفعال است. تصمیم برای تهیه و استفاده از واکسن، جهت یک بیماری براساس نتیجه موازنه دو موضوع، یکی میزان احتیاج به واکسن و دیگری خطرات و عوارض ناشی از آن گرفته میشود.
میزان اثر پیشگیری کننده واکسن یک بیماری، از مقایسه تعداد مبتلایان دو گروه افراد واکسینه شده و نشده‌ای که بطور تصادفی در معرض بیماری قرار می‌گیرند بدست می‌آید.موثرترین واکسن ها آنهایی هستند که مکانیسم پیشگیری حاصل از مرحله بهبودی در شکل طبیعی بیماری را تقلید کنند.
مزیت ایمن‌سازی بر سرم درمانی طولانی مدت بودن آن است.
 واکسنها، علاوه بر تولید فعال پادتن های در گردش ، درموارد خاص، ودر هنگام بروز آلودگیهای بعدی سریعا موجب واکنش لیمفوسیت‌ها گردیده و  دستگاه حساس ایمنی را طوری سامان می دهد که میتواند نسبت به حمله اجرام خارجی واکنش سریع نشان دهد ، این نوع واکنش را پاسخ یاد اور یا خاطره ای می نامند.

جایگاه آزمایش‌های سرولوژیک در بیماری کووید-۱۹

 | تاریخ ارسال: 1399/3/20 | 
جایگاه آزمایش‌های سرولوژیک در بیماری کووید-۱۹

با شیوع بیشتر بیماری یک آزمایش سریع و راحت برای غربالگری گسترده تعداد زیادی از افراد با علائم خفیف و ناقلین بی علامت مورد نیاز است.
تستهای سرولوژیک بیشتر در غربالگری و به ویژه تحقیقات اپیدمیولوژیک کاربرد دارند.
با استفاده از این تست میتوان مواردی مانند توزیع عفونت،عفونت با علائم خفیف،شیوع بیماری در مناطق جغرافیایی،در سنین مختلف،در مشاغل مختلف و در افراد مبتلا به بیماری‌های زمینه‌ای را بررسی نمود.از آنجایی که این بیماری نوظهور است،میزان آنتی‌بادی در جمعیت کشور پایین است و به واسطه آن می‌توان تخمینی از میزان شیوع بدست آورد.
 برای تشخیص اولیه نمی‌توان از تست‌های سرولوژیک استفاده کرد،مزیت این تست در تشخیص عفونت‌های گذشته می‌باشد،زیرا هنگامی که بیمار کووید-۱۹ بهبود یافت و ویروس از بدن پاک شد با روشهای مولکولی مانند RT_PCR قابل تشخیص نمی‌باشد.

توالی یابی سنگر و تشخیص ویروس۲ _SARS_COV

 | تاریخ ارسال: 1399/3/13 | 
توالی یابی سنگر و تشخیص ویروس۲ _SARS_COV



مبنای این تکنیک، استفاده از  نوکلیٔوتیدهای ویژهای موسوم به (ddNTPs (dideoxynucleotids لیبل دار بوده که فاقد گروه OH بر روی کربن ′۳ خود هستند و اگر در ساختار یک اسید نوکلیٔیک قرار گیرند این زنجیره دیگر بلندتر نخواهد شد. 
از آنجاکه نوکلیٔوتیدهای طبیعی در مقادیر بیشتری نسبت به ddNTPها در این پروسه حضور دارند و آنزیم پلیمراز، ddNTPها را بطور اتفاقی به زنجیره در حال ساخت اضافه میکند، در نتیجه  قطعاتی با اندازه‌های مختلف ایجاد می‌گردد.در نهایت این قطعات بواسطه حرارت بصورت تک رشته‌ای تبدیل میشوند و با روش capillary electrophoresis بر اساس طول قطعه و نوکلئوتید لیبل دار موجود در آخر زنجیره خوانده و توالی یابی میشوند.
در تشخیص ویروس SARS_COV_۲ توالی یابی با روش Sanger Sequencing اکثرا برای ژن RNA dependent RNA Polymerase یا همون RdRP برای تشخیص بیماری کویید ۱۹ و با دستگاه هایی مانند ۳۱۳۰xl ABI انجام میشود.در ایران برای اولین بار توالی‌یابی ویروس کرونای جدید در آزمایشگاه دکتر زینلی و با استفاده از این دستگاه انجام پذیرفت.
‏توالی یابی کل ژنوم در تشخیص کمتر استفاده میشود ولی برای پیدا کردن شباهت های ژنومیک و احتمال وجود جهش های جدید در ویروس استفاده می‌گردد.

جهش و ویروسها

 | تاریخ ارسال: 1399/3/7 | 
جهش و ویروسها





ویروس‌ها به دلیل genetic selection و در جهت سازگاری با محیط جدید و بقا مدام در حال تغییر هستند.
نرخ موتاسیون ویروس های RNA دار مانند کروناویروسها از ویروس‌های DNA دار بیشتر است.تنها جهش هایی می‌توانند باقی بمانند که در عملکردهای اساسی ویروس  تداخلی ایجاد نکنند.این جهش ها میتوانند به ویروس خاصیت‌های آنتی ژنیک جدید بدهند.این تغییرات آنتی ژنیکی شاید بتوانند باعث ایجاد بیماری در میزبان جدید شوند. با توجه به وابستگی ویروس به میزبان جهت بقا و تکثیر،یافتن و آلوده کردن میزبان جدید امکان بقای بیشتری به ویروس می‌دهد که این باعث میشود این نوع جهش ها در جمعیت ویروس باقی بمانند.
تمام جهش های اتفاق افتاده در جمعیت ویروس باقی نمی‌مانند،جهش هایی که در عملکردهای اساسی ویروس اختلال ایجاد کنند به زودی از جمعیت حذف می‌شوند.بسیاری از جهش ها هم neutral هستند و باعث تغییری در عملکرد پروتئین ویروس نمیشوند.بنابراین بسته به اینکه جهش ها عملکرد پروتئین های ضروری را تغییر دهند یا خیر دارای اثرات متفاوتی هستند.
توالی یابی اولین قدم در شناسایی جهش های جدید در ویروسها میباشد.پس از توالی یابی و آنالیزهای بیشتر ‌ میتوان به عملکردی بودن یا نبودن این جهش‌ها پی برد.

تست RT_PCR و تشخیص ویروس SARS_COV_۲

 | تاریخ ارسال: 1399/3/6 | 
تست RT_PCR و تشخیص ویروس SARS_COV_۲



 
در مورد روش های مختلف PCR باید این نکته را در نظر داشت که SARS-CoV-۲ یک RNA ویروس هست.

بنابراین نیاز به یک Reverse Transcriptase برای تولید cDNA داریم.
 به این تکنیک PCR اصطلاحا RT-PCR گفته میشود که نتایج آن بر اساس وجود یا عدم وجود ماده ژنتیکی ویروس در نمونه های بیولوژی میباشد.
ژن های مورد توجه در تشخیص کووید۱۹ عبارتند از ژن های مربوط به پروتئین های E, N, و  S, ژن RdRP, ژن ORF۱ab, ژن ORF۱b-nsp ۱۴.

در ابتدا PCR ها فقط در نقطه انتهای کار دستگاه (End-point Analysis) وجود یا عدم وجود پاتوژن را به ما گزارش میدادند (Conventional PCR). حال اما میتوان در طی زمان و به صورت زنده Amplification ویروس را ردیابی کرد. به این روش real-time PCR میگویند.

دستگاه های real-time PCR میتوانند Semi-Quantitative یا Quantitative باشند.
در حالت Semi-Quantitative, اگر مقدار فلورسانس ساطع شده دستگاه از حدی مشخص فراتر رود بعد از تعداد خاصی چرخه ی PCR (Cycle Threshold: Ct), میتوانیم بگوییم نمونه مثبت، Indeterminate, یا منفی است.


تست RT-PCR برای شناساسی SARS_COV۲_RNA در نمونه های تنفسی بیماران کاربرد دارد.یک تست مثبت RT_PCR برای این ویروس تایید کننده تشخیص بیماری کویید۱۹ است.اگرچه نتایج مثبت کاذب که عموما ناشی از آلودگی محیط و نمونه ها هنگام آزمایش است نیز وجود دارد.نتایج منفی کاذب از نمونه های دستگاه تنفسی فوقانی نیز گزارش شده است.WHO پیشنهاد میدهد در مواردی که در فردی تست اولیه RT_PCR منفی شد اما همچنان به بیماری کویید۱۹ مشکوک هستید، در صورت امکان نمونه گیری از دستگاه تنفسی تحتانی انجام شود چرا که میزان بار ویروس در دستگاه تنفسی تحتانی بیشتر است و سبب نتایج مثبت بیشتری میشود،بنابراین دقت این آزمایش بسیار به نوع نمونه بیولوژیک مرتبط میباشد

روش های مختلف آزمایشگاهی برای تشخیص COVID-۱۹

 | تاریخ ارسال: 1399/2/31 | 
روش های مختلف آزمایشگاهی برای تشخیص COVID-۱۹





به طور کلی ‌۳ روش تشخیصی مطرح است:
‏۱-مولکولی
‏۲-سرولوژیک
‏۳-کشت

‏در حال حاضر، روش های مولکولی بیشترین استفاده را در تشخیص SARS-CoV-۲ دارند.این روش ها عبارتند از:

‏۱-PCR
‏۲-Sequencing

‏PCR بیشترین کاربرد را در تشخیص این بیماری دارد که بر اساس وجود یا عدم وجود ماده ژنتیکی ویروس استوار است.
‏توالی یابی کل ژنوم در تشخیص کمتر استفاده میشود ولی برای پیدا کردن شباهت های ژنومیک بین ویروس افراد بیمار و احتمال وجود جهش ها استفاده میشود.

مشکل روش های مولکولی این است که نمیتوان به صورت گذشته نگر فهمید چه کسانی مریض هستند (مثلا برای افراد کم علامت یا بی علامت) و یا چه کسانی احیانا ایمن هستند.علاوه بر آن با توجه به دشواری نمونه گیری احتمال نتیجه منفی کاذب در آن بالاست.

اینجاست که روش های سرولوژیک به کار می آیند (IgG و IgM ضد انتی ژن های ویروسی مثل nucleoprotein و receptor binding domain پروتئن S). البته شاید نقطه ی ضعف روش های سرولوژیک این باشد که نتوان از آنها در ابتدای بیماری افراد استفاده کرد زیرا شاید هنوز آنتی بادی ها تولید نشده باشند

روش های کشت بیشتر جنبه ی تحقیقاتی دارند مثلا برای تایید وجود ویروس زنده در سطوح مختلف، میزان واگیردار بودن بیماری بین افراد، و مهار کردن infection سلول های کشت شده در ازمایشگاه برای تست درمان های احتمالی استفاده میشود.

پدیداری و شناسایی کرونا ویروس جدید

 | تاریخ ارسال: 1399/2/23 | 
پدیداری و شناسایی کرونا ویروس جدید :

 

در اواخر سال ۲۰۱۹ تعدادی پنومونی غیرقابل توضیح در ووهان چین گزارش شد که هیچ کدام از کیتهای تشخیصی موجود نتوانستند عامل پاتوژن را شناسایی کنند.از ۹ بیمار در ۳ بیمارستان مختلف نمونه برداری شد و مشخص گردید این ویروس از خانواده ی کروناویروس ها می‌باشد اما توالی ژنومی آن به هیچ یک از ویروسهای قبلی این خانواده تعلق ندارد.توالی ویروسی مشتق از  این ۹ بیمار همولوژی(شباهت) ۹۹.۹۸درصدی با هم نشان میداد که به معنای منشا یکسان آلودگی و انتشار سریع ویروس بود.۸ نفر از این افراد با بازار غذاهای دریایی ووهان در تماس بودند.آنالیزهای فیلوژنی بیشتر نشان داد که توالی ویروس جدید بیشترین شباهت را به سویه های مشتق شده از خفاش که قبلا در بانک جهانی ژن ثبت شده بود دارند.با توجه به نرخ جهش و مقدار تفاوتهای موجود در توالی ویروس جدید و سویه های مشتق شده از خفاش احتمال وجود یک ناقل دیگر به عنوان واسطه وجود داشت که تحقیقات بیشتر این احتمال را مطرح کرد که این واسطه میتواند پنگولین بوده باشد اما مخزن اصلی ویروس در طبیعت خفاش میباشد.

درباره ویروس کرونا بیشتر بدانیم

 | تاریخ ارسال: 1399/2/21 | 
          
درباره ویروس کرونا بیشتر بدانیم :
 


            ۱- ویروس کرونا چیست  
     ۲- پدیداری و شناسایی کرونا ویروس جدید   
     ۳-روش های مختلف آزمایشگاهی برای تشخیص COVID-۱۹
     ۴- تست RT_PCR و تشخیص ویروس SARS_COV_۲
      ۵-جهش و ویروسها
      ۶-
 
توالی یابی سنگر و تشخیص ویروس۲ _SARS_COV
                                                                                                 ۷- 
جایگاه آزمایش‌های سرولوژیک در بیماری کووید-۱۹    
                                                                                                 ۸-
واکسن     


کرونا ویروس چیست

 | تاریخ ارسال: 1399/2/21 | 
 
کرونا ویروس چیست؟


کروناویروس ها شامل ویروس های RNA دار تک رشته ای و دارای envelope هستند.ژنوم کرونا سنتز و کدینگ ۴گروه پروتئین ساختمانی ویروس را بر عهده دارد:
۱-پروتئین Spike (آنتی ژن S)که بصورت زوائد میخی بیرون زده مشاهده میشود و در شناسایی و ورود ویروس به سلول میزبان دخالت دارد.
۲- پروتئین نوکلئوکپسید (آنتی ژن N) در سنتز RNA ویروس و در نتیجه تکثیر ویروس اهمیت دارد.
۳پروتئین غشایی (آنتی ژن M) به ویروس شکل میدهد و انحنای غشایی را تقویت میکند و به نوکلئوکپسید متصل میشود.
۴-پروتئین envelope (آنتی ژن S) در مونتاژ و رهاسازی و پاتوژنز ویروس نقش دارد.

انواع متفاوتی از ویروسهای کرونا وجود دارند که باعث ایجاد علائم تنفسی و گاهی اوقات علائم مربوط به دستگاه گوارش میشوند.بیماری تنفسی میتواند از سرماخوردگی مرسوم تا ذات الریه(پنومونی) را در بربگیرد.در بیشتر افراد این علائم ضعیف ظاهر میشوند هرچند ویروس های کرونایی وجود دارد که میتوانند باعث بیماری های حاد شوند مانند SARS-COV که در سال ۲۰۰۳ در چین باعث بیماری سارس شد و MERS-COV که در خاورمیانه شناسایی شد،این ویروسها عامل سندرم حاد تنفسی در قرن اخیر بودند و کروناویروس جدید که از سوی سازمان بهداشت جهانی SARS-COV-۲ نامگذاری شده و باعث بیماری کویید ۱۹ میباشد نیز از این خانواده میباشد.